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1、β折疊怎么消除
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一、β折疊怎么消除
又稱β片層結(jié)結(jié)構(gòu),β-折疊為—種比較伸展、呈鋸齒狀的肽鏈結(jié)構(gòu),當(dāng)兩段以上的β-折疊結(jié)構(gòu)平行排布并以氫鍵相連所形成的結(jié)構(gòu)稱為β-片層或β-折疊層。是蛋白質(zhì)的一種二級(jí)結(jié)構(gòu)。在beta-折疊中(英語(yǔ):pleatedsheet),兩條以上胺基酸鏈(肽鏈),或同一條肽鏈之間的不同部分形成平行或反平行排列,成為“股”。肽平面之間呈手風(fēng)琴狀折疊,股與股之間會(huì)通過(guò)氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內(nèi)。胺基酸殘基的R側(cè)鏈分布在片層的上下。
簡(jiǎn)介
存在于各種天然蛋白質(zhì)中的一種特定的瓦楞狀立體結(jié)構(gòu),又稱β-片層。如果把毛發(fā)等不溶性蛋白質(zhì)在熱水中浸泡,并用力拉伸,就可發(fā)現(xiàn)這些物質(zhì)的結(jié)構(gòu)是β-折疊層。蠶絲的絲心蛋白在天然狀態(tài)下也有同樣的結(jié)構(gòu)。在大多數(shù)情況下,β-折疊層是兩條或兩條以上肽鏈并列在一起,彼此以氫鍵連接構(gòu)成的層狀結(jié)構(gòu)(圖1)。層狀結(jié)構(gòu)中的肽鏈彼此間或平行排列(N端同處一側(cè)),或反平行排列(N端分處兩側(cè)),分別構(gòu)成平行和反平行β-折疊層。平行和反平行折疊層折疊程度稍有差異,如第1氨基酸殘基的α-碳原子與順序上第3氨基酸殘基的α-碳原子的距離,在平行β-折疊層中為 6.5埃,在反平行β-折疊層中是7.0埃(圖2)。
發(fā)展歷史
60年代以來(lái),球狀蛋白質(zhì)的晶體結(jié)構(gòu)被陸續(xù)解出,發(fā)現(xiàn)許多蛋白質(zhì)中都有β-折疊層,平行的和反平行的都有。有時(shí)候許多段肽鏈排列成一大片,正、反平行的β-折疊層也可交錯(cuò)在一起排列,構(gòu)成“扭轉(zhuǎn)折疊層”。在多數(shù)蛋白質(zhì)中,β-折疊層與α-螺旋是并存的,但也有個(gè)別蛋白質(zhì)如免疫球蛋白 IgG的分子中只存在β-折疊層和無(wú)特定結(jié)構(gòu)的部分。
Beta-折疊層并不是平的,因?yàn)閭?cè)鏈的存在使得它看上去像手風(fēng)琴一樣波紋起伏。這樣每一股會(huì)更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中beta-折疊通常會(huì)用箭頭表示。肽鏈的氮端在同側(cè)為順式,兩殘基間距為0.65nm;不在同側(cè)為反式,兩殘基間距為0.70nm。反式較順式平行肽鏈更加穩(wěn)定。能形成β折疊的胺基酸殘基一般不大,而且不帶同種電荷,這樣有利于多肽鏈的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折疊中出現(xiàn)的幾率最高。免疫球蛋白有大量的Β-肽鏈層。
另一種常見的蛋白質(zhì)模序是alpha-螺旋和三種不同的β-轉(zhuǎn)角。不屬于一個(gè)模序的蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)部分被稱之為不規(guī)則螺旋。這些部分對(duì)蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象非常重要。
二、β折疊股或β股(β-strand)和β折疊是一個(gè)意思嗎 它們有什么聯(lián)系
β-折疊(β-sheet)也是一種重復(fù)性的結(jié)構(gòu),可分為平行式和反平行式兩種類型,它們是通過(guò)肽鏈間或肽段間的氫鍵維系??梢园阉鼈兿胂鬄橛烧郫B的條狀紙片側(cè)向并排而成,每條紙片可看成是一條肽鏈, 稱為β折疊股或β股(β-strand),肽主鏈沿紙條形成鋸齒狀,處于最伸展的構(gòu)象,氫鍵主要在股間而不是股內(nèi)。α-碳原子位于折疊線上,由于其四面體性質(zhì),連續(xù)的酰氨平面排列成折疊形式。需要注意的是在折疊片上的側(cè)鏈都垂直于折疊片的平面,并交替的從平面上下二側(cè)伸出。平行折疊片比反平行折疊片更規(guī)則且一般是大結(jié)構(gòu)而反平行折疊片可以少到僅由兩個(gè)β股組成。
三、α螺旋和β折疊各有什么特點(diǎn)?
首先,他們都是蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)。α-螺旋:1、 每隔3.6個(gè)AA殘基螺旋上升一圈,螺距0.54nm; 2 、 螺旋體中所有氨基酸殘基R側(cè)鏈都伸向外側(cè),鏈中的全部>C=0 和>N-H幾乎都平行于螺旋軸; 3、每個(gè)氨基酸殘基的>N-H與前面第四個(gè)氨基酸殘基的>C=0形成氫鍵,肽鏈上所有的肽鍵都參與氫鍵的形成。β-折疊:(應(yīng)該是你所說(shuō)的螺旋)兩條或多條伸展的多肽鏈(或一條多肽鏈的若干肽段)側(cè)向集聚,通過(guò)相鄰肽鏈主鏈上的N-H與C=O之間有規(guī)則的氫鍵,形成鋸齒狀片層結(jié)構(gòu),即β-折疊片
參考資料:http://zhidao.baidu.com/question/213259226.html四、生物化學(xué)關(guān)于a-螺旋,β-折疊的計(jì)算題 急?。。?/strong>
設(shè)x個(gè)螺旋y個(gè)折疊,120×(X+Y)=240000, 0.15×10-7 X +0.35×10-7 Y= 5.06×10-5,解方程就好,最后X=970,Y=1030
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